ترجمه مقاله NCBI GEO: archive for functional genomics data sets—۱۰ years on(BI GEO: آرشیو ۱۰ ساله مجموعه های داده کارکردی ژنوم)

مقاله با عنوان:NCBI GEO: archive for functional genomics data sets—۱۰ years on از اينجا دانلود كنيد

عنوان مقاله به فارسى:BI GEOآرشیو ۱۰ ساله  مجموعه های داده کارکردی ژنوم

پشتیبانی : دارد. در صورت هر گونه بروز مشکل با شماره تلفن 09367938018 یا آی دی تلگرام@research_moghimi تماس حاصل فرماييد.

کیفیت محصول :عالى

قيمت:9000 تومان

قسمتى از ترجمه محصول:

چکیده

 GEO (Gene Expression Omnibus) در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) بزرگترین مخزن کاملا عمومی برای داده های فراوانی مولکولی با توان عملیاتی بالا و مخصوصاٌ داده های جلوه  ژن می باشد.  این پایگاه داده دارای طراحی انعطاف پذیر و باز می باشد که ارسال ، ذخیره سازی و بازیابی بسیاری از انواع داده ها را امکان پذیر می سازد. این داده ها شامل از تجربیات مبتنی بر ریزآرایه برای آزمایش اندازه گیری فراوانی mRNA ، DNA ژنوم و مولکولهای پروتئین ، و همچنین فن آوری های غیرمبتنی بر آرایه مانند تجزیه و تحلیل سریال جلوه  ژن (SAGE) و تکنولوژی پروتئومی طیف سنجی جرمی می باشد.

در حال حاضر GEO بالغ بر ۳۰۰۰۰ ارسالی که معرف بیش از حدود نیم میلیارد اندازه گیری فراوانی مولکولی برای بیش از ۱۰۰ ارگانیسم می باشد را در بر می گیرد. در اینجا ، ما تحولات اخیر پایگاه داده ها که کاوش و تجسم این داده ها را به طور مؤثر تسهیل می کند  بیان می کنیم.

ویژگیهایی برای  بررسی داده های بدست آمده هم از طریق تجربه و هم از طریق دیدگاههای ژن محور، با استفاده از رابطهای موجود کاربر پسند مبتنی بر وب بدون داشتن تخصص محاسباتی یا تحلیلهای مبتنی بر ریزآرایه ها ارائه می شود. پایگاه داده GEO از طریق شبکه جهانی وب در سایت http://www.ncbinlm.nih.gov /  برای عموم قابل دسترسی است.

Abstract

A decade ago, the Gene Expression Omnibus (GEO) database was established at the National Center for Biotechnology Information (NCBI). The original objective of GEO was to serve as a public reposi­tory for high-throughput gene expression data generated mostly by microarray technology. However, the research community quickly applied microarrays to non-gene-expression studies, including examination of genome copy number vari­ation and genome-wide profiling of DNA-binding proteins. Because the GEO database was designed with a flexible structure, it was possible to quickly adapt the repository to store these data types. More recently, as the microarray community switches to next-generation sequencing technologies, GEO has again adapted to host these data sets. Today, GEO stores over 20000 microarray- and sequence-based functional genomics studies, and continues to handle the majority of direct high-throughput data submissions from the research community. Multiple mechanisms are provided to help users effectively search, browse, download and visualize the data at the level of individual genes or entire studies. This paper describes recent database enhancements, including new search and data representation tools, as well as a brief review of how the commu­nity uses GEO data. GEO is freely accessible at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo